MovableTypeのアップグレードのやり方がよくわからない

そうそう、ボクも今朝まこなこにアクセスして焦りました。
サイトリニューアル中ってのはわかってたけど、結局は元に戻したのね。

変えなくてもいいと思うのはボクだけかな？

記事をどう格納しているかによりますが。
MySQL等使っていたら、記事はそことは別の所にあるかと。
SQL LiteとBerkeley DBなら指定ディレクトリ以下に実体があるので、mt-config.cgiを確認してください。
というかディレクトリの説明は「新規インストールの事前準備」にありますよ。

マニュアルでは、混在を避けるために前のバージョンを消してから導入するようにありますが、
私は以前のバージョンとは別の所に次期バージョンを置いて、そこでテストしてから前のを消すようにしています。
まあmt-config.cgiさえきちんとなっていれば、あとはパスワードを忘れていないかどうかぐらいのはず。

追加。
個人的には、MTのマニュアルの「システム管理者ガイド」の部分を、一度印刷して、
眺め確認しつつやっていくのがいいかと思います。
ディレクトリが普通どうなっているかも「新規インストール（Linux, BSD, Mac OS X）」の項にありますし。

あと、プラグインを後から追加していたりしていたら、
プラグインも以前のバージョンの所からコピーする必要があります。

今のMTのアップデートは、基本的に、分かればなんてことない内容ですので、
おっくうがらずに頑張ってください。

繰り返し読んでみてふと気付いた。
まこちゃん、教えて欲しいのならもっと謙虚な姿勢を見せないと。
あんまり高飛車だとどこかの知事みたいじゃん。

何でシックスアパートに聞かんのだ？

簡単に言えば、エントリー、コメント、テンプレ、スタイルシートとか肝心なものはデータベースに格納されているので、このDBと設定ファイルのmt-config.cgi以外は新しいバージョンに入れ替わるという感じでよかったはず。

アーカイブとか普段読者が目にしている部分は、MTがデータベースを元に生成した静的HTML。

バージョンアップしてからやり直さなくてはいけないものは、自分で導入したプラグインとか（もしやっていたらインターフェイスとかの改造も）。